Tématem stálé expozice Soběslav – město pětilisté růže, slavnostně otevřené v rámci 3. noci v Blatském muzeu dne 27. 5. 2014, je více než čtyři staletí trvající rožmberské období dějin města i zdejší "druhý život" Rožmberků.

Mezi exponáty dominuje unikátní gotická skříň (městská pokladnice) snesená v roce 2013 z věže při kostelu sv. Petra a Pavla a po restaurování osazená původními dekorativními prvky z muzejních sbírek. Dalšími skvosty umělecko-historicky zaměřené expozice jsou gotické i raně barokní obrazy a plastiky ze soběslavských kostelů založených rožmberskými vladaři a z kostela sv. Marka. Ten nechal postavit místní primas Zachariáš Marek Markovský až po smrti Petra Voka, přesto však s rožmberskými symboly.

Markovský tak zahájil "druhý život" Rožmberků ve městě, na němž se později podílela schwarzenbergská vrchnost (což dokládá obraz Petra Voka jako doplněk portrétů Adama Františka a Eleonory Amálie z roku 1730) i městské obyvatelstvo (Zpěvácký spolek Petr Vok založený roku 1862) a který pokračuje až do současnosti (Rožmberské slavnosti, zvon Petr Vok atd.). Historii města v době rožmberské vlády dokládají také archeologické nálezy z průzkumů prováděných v prostoru soběslavského hradu a náměstí. Tehdejší Soběslav sevřenou hradbami, vodním příkopem a Černovickým potokem zobrazuje model (170 x 170 cm), který vznikl na objednávku města a expozici obohatil během roku 2015.