Výstava Školákem ve válečných letech se zaměřuje na školní prostředí protektorátu Čechy a Morava a odtrženého československého pohraničí v letech 1938–1945.

Školákem ve válečných letech přináší informace nejen o stavu českého školství a perzekuci českých studentů, ale také o vzdělávání židovské a romské mládeže, o německých školách na našem území a v neposlední řadě také o mimoškolním vzdělávání. Součástí výstavy jsou také výsledky badatelské činnosti celkem 15 školních týmů z celé České republiky.