Pivovar vznikl přestavbou rožmberské zbrojnice v první polovině 17. století, do provozu byl uveden v roce 1630 Janem Oldřichech z Eggenberku, novým majitelem českokrumlovského zámku.

Eggenberský majetek zdědil v roce 1719 rod Schwarzenberkovů, pivovarnictví v té době nabylo velkého významu. Tohoto majetku se Schwarzenberkové vzdali ve čtyřicátých letech minulého století.

Dnes je pivovar přístupný prohlídkám veřejnosti, v jeho prostorách je provozována také restaurace.